O agente especial do FBI Fox Mulder (David Duchovny) fez seu nome trabalhando em arquivos X-casos indicados que podem ser de origem paranormal. Ele é nomeado parceiro nessas investigações - Dana Scully (Gillian Anderson) - com seus superiores esperando que ela possa desmascarar e desacreditar seu trabalho. Seu primeiro caso juntos é a investigação de possíveis seqüestros no Oregon, que vacila quando suas evidências são destruídas em um incêndio. Um caso posterior, envolvendo o desaparecimento de um piloto de teste da Força Aérea dos Estados Unidos, vê a introdução de uma garganta profunda secreta (Jerry Hardin), que continua a fornecer informações confidenciais aos agentes. Essa ajuda é complementada pelo grupo teórico da conspiração, os homens armados solitários, que são contatados para obter ajuda em um caso de seqüestro adicional. A garganta profunda é morta logo, no entanto, quando ele ajuda os agentes a descobrir detalhes de um programa de clonagem humana do governo, e a unidade de arquivos X é fechada logo depois.
Incapaz de continuar seu trabalho com Scully, Mulder obtém informações sobre o possível contato extraterrestre em Porto Rico, descobrindo que o programa SETI no Observatório Arecibo está sendo fechado à força. Embora mais tarde o par possa retomar seu trabalho, Scully é posteriormente sequestrado por um abduzido alienígena, Duane Barry. Barry leva Scully a um colina onde ela é sequestrada, presumivelmente por alienígenas. Ela é encontrada em coma em uma data posterior, tendo chegado misteriosamente a um hospital e se recupera vários dias depois.
Mulder recebe uma ligação de seu pai, descobrindo que sua irmã Samantha (Megan Leitch), que havia sido sequestrada quando criança, voltou. Samantha está sendo perseguida por um caçador de recompensas, que está assassinando clones humanos. Samantha é morta, embora seja revelada que ela era simplesmente um dos vários clones, produzidos usando tecido alienígena para criar um híbrido alienígena-humano.
Os atiradores solitários entrem em contato com Mulder e Scully sobre uma tentativa bem -sucedida de um amigo deles de invadir o sistema de computadores do Departamento de Defesa dos Estados Unidos. O hacker, Kenneth Soona (Bernie Coulson), é capaz de dar a Mulder as informações baixadas em uma cassete digital. No entanto, Soona é posteriormente assassinado e os arquivos baixados foram escritos no Navajo. Entrando em contato com Albert Hosteen (Floyd Red Crow Westerman)-Um homem navajo capaz de traduzir os arquivos-o Mulder é mostrado um carro cheio do que parece ser cadáveres alienígenas. Ele está preso na caixa do antagonista da série, o homem de fumantes (William B. Davis), e deixou para morrer depois de ser destruído. Mais tarde, ele é encontrado e amamentado de volta à saúde por Hosten. Enquanto isso, Scully investiga o possível envolvimento do programa de erradicação da varíola em experimentação genética humana, descobrindo que um cientista nazista que desertou durante a operação Paperclip tem conduzido a experimentação humana para criar híbridos alienígenas-humanos. Sua irmã Melissa (Melinda McGraw), no entanto, é baleada por assassinos que a confundem com Dana e morre no hospital naquela noite.
Quando a série começou, Chris Carter não pensou em criar uma "mitologia" para os episódios focados na vida extraterrestre, porque ele sentiu que "eram apenas histórias que queríamos contar". Eventualmente, no entanto, os escritores viram que os episódios mais "pessoais" eram aqueles baseados na conspiração do governo. Outra razão para o desenvolvimento de uma mitologia em andamento foi que os produtores tinham medo de não criar um fio entre os episódios centrados na conspiração, sentindo que seria pretensioso não fazê -lo.
Segundo Carter, a mitologia "surgiu de" A série "Pilot e seu acompanhamento" Deep Garath ", que estabeleceu a idéia de que alienígenas estavam na Terra há muitos anos. Carter vê a cena final de "Deep Garath" como o "momento de lançamento para toda a mitologia". O tema principal da série, decorrente desses episódios, é a busca de Fox Mulder para encontrar "The Truth" sobre sua irmã, Samantha Mulder, que havia sido sequestrada quando criança. Essa missão levou o personagem a investigar o paranormal, definindo a estrutura da série.
Após vários episódios independentes, com OVNIs e extraterrestres no início da primeira temporada, a mitologia do programa se desenvolveu amplamente baseada na gravidez da atriz Gillian Anderson, que engravidou no meio da produção da primeira temporada. O produtor executivo Frank Spotnitz o descreveu como "a melhor coisa que já aconteceu com a série", observando que a mitologia "realmente acabou passando pela vida da série, tudo porque Gillian Anderson engravidou". Embora houvesse inicialmente pensamentos sobre o personagem de Anderson, Scully dando à luz a uma criança alienígena, os escritores decidiram contornar a gravidez de Anderson. Os escritores decidiram fechar os arquivos X no final da temporada para separar Mulder e Scully um do outro, e sequestraram Scully, reaparecendo vários episódios depois. Além da criação do enredo referente ao seqüestro de Scully, o papel reduzido de Anderson na primeira metade da segunda temporada permitiu que os escritores desenvolvessem alguns dos outros personagens do programa, incluindo o diretor assistente Walter Skinner (Mitch Pileggi), o homem fumando ( William B. Davis) e X (Steven Williams) e resultou na introdução do personagem Alex Krycek (Nicholas Lea). Krycek, que foi criado inicialmente pelo escritor Howard Gordon para substituir temporariamente Scully como parceiro de Mulder por três episódios acabou se transformando em um personagem que durou sete temporadas no programa.
Antes do episódio da segunda temporada, "One Breath", o homem de fumar "espreitava -se nas sombras", fornecendo uma presença "proibindo". O homem de fumar pronunciou apenas quatro palavras audíveis em toda a primeira temporada do show, todas elas em "Tooms". O produtor e diretor R.W. Goodwin não teve fé na capacidade de William B. Davis de assumir o papel do principal antagonista da série. Mais tarde, foi revelado aos produtores que Davis estava administrando uma escola de atuação e ensinando atores como a estrela convidada da nona temporada Lucy Lawless.
Na história de duas partes de "Colony" e "End Game", Carter e Spotnitz, junto com Duchovny, criaram o que se tornaria um personagem recorrente no Hunter de Bounty Alien. Segundo Carter, Duchovny veio até ele e disse: "É ótimo se tivéssemos como um caçador de recompensas alienígenas", uma idéia da qual Carter aprovou. Spotnitz observou que o ator elenco para o papel, Brian Thompson, foi escolhido porque ele tinha um olhar muito "distinto" sobre ele, principalmente seu rosto e boca.
Lançado em 7 de junho de 2005, a coleção recebeu críticas geralmente positivas dos críticos. Keith Uhlich, da revista SLANT, classificou três estrelas em cinco, elogiando a qualidade dos episódios incluídos no set, mas, finalmente, descobrindo que eles eram melhor vistos no contexto dos episódios "independentes" que foram omitidos - lançando "conduíte" e "The Jersey Devil" como episódios que ajudariam o "estudo duplo de caráter" da série. Escrevendo para o IGN, Dan Iverson classificou a coleção oito em cada dez, descobrindo que os episódios baseados em mitologia formaram a base do relacionamento entre os personagens de Mulder e Scully. Fazendo referência ao episódio da primeira temporada "Squeeze", não incluído na coleção, ele acrescentou que "mesmo que as pessoas assistissem a série para ver pequenos homens verdes e monstros elásticos que comem fígado, foi o relacionamento entre os dois que fizeram o Série um sucesso total ". No entanto, ele descobriu que o material extra do conjunto era escasso, descrevendo -o como sendo apenas o suficiente "para nos impedir de reclamar". Ao escrever para DVD Talk, Jeffrey Robinson ficou impressionado com a coleção, descobrindo que os episódios em destaque funcionaram bem juntos sem perder a coesão e afirmando que "se você é um espectador casual ou um fã que já possui a temporada, possui o proprietário do X-Files Mitologia, Volume 1: A abdução é uma obrigação ". Monica S. Kuebler, de Exclaim! Cinco comentários e um médico valem a pena, porque é provável que você goste dos arquivos X ... provavelmente já comprou os episódios incluídos aqui pelo menos uma vez ".