Agucchi nasceu em uma família nobre em Bolonha. Ele começou sua carreira em 1580-82, ajudando seu irmão muito mais velho, Girolamo Agucchi (1555-1605), mais tarde um cardeal de 1604 a 1605, que era governador de Faenza nos estados papais, depois estudou em Bolonha e Roma. Ele foi nomeado cânone da Catedral de Piacenza e, de 1591, trabalhou para seu tio cardeal Filippo Sega, um importante diplomata para o papado, acompanhando -o quando a Sega era núncio papal (embaixador) na França, depois retornando com ele para Roma em 1594, e continuando em seu serviço até a morte de Sega em 1596.
Ele então seguiu seu irmão Girolamo a serviço do cardeal Pietro Aldobrandini, secretário de Estado papal, cujo secretário era Girolamo. Aldobrandini era sobrinho do Papa Clemente VIII (r. 1592-1605). Agucchi acompanhou Aldobrandini em suas embaixadas a Florença e França, este último para negociar o Tratado de Lyon (1601) e o casamento de Henrique IV da França, então em 1604 a Ravenna, onde Aldobrandini foi feito arcebispo, com uma viagem a Ferrarara em o mesmo ano. A morte do Papa Leo Xi e seu substituto pelo Papa Paul V em 1605 significavam a perda de favor papal para ambos os homens, e Agucchi conseguiu passar a maior parte do tempo em seus interesses pessoais até 1615, quando Aldobrandini voltou a favorecer e o cargo. Ele também era um protegido do cardeal Odoardo Farnese, que gosta de arte, atuando como sua secretária.
Aldobrandini morreu em 1621 e Agucchi se tornou secretário (Segretario dei brevi) para o novo papa Gregory XV, também de Bolonha, no mesmo ano. Gregory morreu em 1623 e, no mesmo ano, seu sucessor urbano VIII fez de Agucchi Bishop de Amasea em Partibus Infidelis (um papel titular, já que o Amasea está no leste da Turquia) e o nomeou como núncio apostólico para a República de Veneza. A política veneziana foi altamente polarizada entre facções pró e anti-papaias, e o período de Agucchi coincidiu em grande parte com o reinado instável de Doge Giovanni I Cornaro (r. algo de desastre. Agucchi deixou Veneza em 1630 para evitar a praga e morreu no ano seguinte no Castello San Salvatore em Susegana, depois de um período em Oderzo.
Agucchi era um intelectual cultivado, e o amigo de muitos artistas, desempenhando um papel significativo na introdução de pintores de sua mordida nativa para os clientes na Cúria Romana. Ele era "um correspondente assiduoso por conta própria e em outros", e muitas cartas não publicadas sobrevivem, bem como as citadas por Carlo Cesare Malvasia em suas obras. Ele freqüentemente surge na discussão das comissões romanas do período, por exemplo, sugerindo Ludovico Carracci às autoridades para um retábulo em São Pedro, Roma, embora sem sucesso. Annibale Carracci tinha sua própria recomendação ao cardeal Odoardo Farnese do irmão do cardeal Ranuccio I Farnese, duque de Parma, mas tornou -se amigo de Agucchi em Roma, e é mantido como modelo em seus escritos, que também contêm importantes informações biográficas sobre o Carracci. Agucchi pode ter aconselhado Carracci sobre a iconografia mitológica complicada e aprendida em seus afrescos dos amores dos deuses pelo Palazzo Farnese do cardeal, o esquema deslumbrante que foi a primeira comissão de Carracci em Roma e continua sendo um trabalho marcado para o barroco romano. Ele administrou sua última comunhão a Annibale antes de sua morte prematura em 1609 e compôs seu epitáfio para o panteão.
Domenichino se juntou a Carracci em seu trabalho no Palazzo Farnese, e Agucchi e seu irmão o apresentaram ao cardeal Pietro Aldobrandini e ao futuro Gregory XV. Domenichino viveu na casa de Agucchi por um período de 1603/4 a 1608, e de acordo com Bellori, uma das figuras da reunião de Fresco de Domenichino de São Nilus e Imperador Otto III (c. é um retrato de Agucchi.
Os cardeais Odoardo Farnese e Pietro Aldobrandini se opuseram politicamente, embora menos depois de um casamento entre as duas famílias em 1600, mas foram os dois principais apoiadores da pintura à bolonhesa em Roma, que entre eles conseguiram efetivamente dar ao bolonhoso "quase um monopólio" de Grandes comissões para palácios nos anos 1610. O gosto pessoal do cardeal Aldobrandini era o estilo maneirista tardio de Giuseppe Cesari (o Cavaliere d'Arpino) e outros, e seu apoio ao bolonhês deve ser amplamente atribuído à advocacia de Agucchi. O cardeal encomendou Domenichino para pintar oito afrescos com a história de Apollo para a Villa Aldobrandini nos arredores de Roma em 1616-18; Eles estão agora na Galeria Nacional, Londres. O irmão mais velho de Agucchi, cardeal Girolamo, contratou Domenichino para pintar três afrescos na vida de Saint Jerome, no pórtico de Sant'onofrio, em Roma, que ainda estão em vigor. Isso foi em 1604, concluído em 1605, na época em que Domenichino morava com Agucchi. A igreja também contém o retrato de Domenichino do tio de Agucchis, o cardeal Sega, em seu memorial.
De Annibale Carracci, o cardeal Aldobrandini encomendou um conjunto de afrescos decorativos com assuntos religiosos em paisagens para seu palácio em Roma, agora contendo a Galeria Doria Pamphilj e ainda na família, o Domine, Quo Vadis? Na Galeria Nacional, Londres, e uma coroação da Virgem comprada pelo Metropolitan Museum of Art da Mahon Collection. Em 1603, ele possuía seis obras de Carracci, incluindo duas das opções acima. O artista bolonhês Guercino passou apenas os anos do papado de Gregory XV em Roma, onde seu estilo mudou na direção do classicismo. Denis Mahon sugeriu que essa mudança estava principalmente em resposta às urgências de Agucchi; Como a maioria dos comentaristas, Mahon pensou que a mudança não era em geral uma melhoria. Eva-Bettina Krems sugere que Agucchi é um candidato provável para a conexão que introduziu o escultor Lombard Ippolito Buzzi ao cardeal Ludovico Ludovisi, que forneceu um fluxo constante de trabalho a ele ao longo de vários anos.
O belo e íntimo retrato na Galeria de Arte de York (ilustrado) sempre foi atribuído a Domenichino até que um artigo em 1994 propôs que foi por Annibale Carracci, por volta de 1603; Foi de propriedade de Agucchi até sua morte. Quando a Galeria de York foi fechada para reconstrução em 2014-15, foi emprestada à National Gallery, Londres, e exibida lá. Domenichino e Agucchi colaboraram no Monumento a Girolamo Agucchi na Igreja de San Giacomo Maggiore em Bolonha, para os quais há desenhos na Coleção Real Britânica (Royal Library, MS. 1742).
A principal redação publicada de Agucchi é uma Trattato della Pittura muito incompleta, mas significativa, escrita em 1615, cujo manuscrito está na Biblioteca da Universidade de Bolonha (MS. 245), que também possui um latim não publicado Biografia de seu irmão Vita Hieronymi Agucchi (MS 75). O Trattato foi publicado postumamente em Roma em 1646, usando o pseudônimo Gratiadio Machati, que Agucchi havia usado em sua vida (uma convenção para uma escrita clérigo sobre assuntos seculares). Foi incluído no prefácio de G. A. Mosini, o pseudônimo de Giovanni Antonio Massani, a uma coleção de impressões depois que Annibale Carracci chamou diversas figuras al numero di ottanta ("oitenta figuras diferentes"). Há uma tradução em inglês de Denis Mahon (1947), que fez muito para estimular o interesse em Agucchi como teórico que havia sido anteriormente negligenciado.
O Trattato "é um documento animado sobre círculos oficiais de arte romana durante os anos 1607-15 e concentra -se especificamente em exaltar a idéia della Bellezza, que Agucchi identifica particularmente na escultura antiga". O trabalho mostra sinais de ter sido influenciado por discussões com Domenichino, refletindo uma divisão de escolas de pintura nacional e regional que as últimas reivindicavam como sua em uma carta, e é essencialmente a usada até o século XX, distinguindo na Itália o romano, Escolas venezianas, Lombard e Toscana (Florentina e Sienesa). Foi sugerido que o Trattato pode ter sido uma colaboração, com a prosa polida de Agucchi escrevendo os pensamentos de Domenichino, embora esse seja principalmente considerado o caso.
Agucchi retirou -se do pensamento neoplatonista, no qual "a natureza é a reflexão imperfeita do divino, e o artista deve melhorá -la para alcançar a beleza", uma visão já convencional no século anterior. Ele sustentou a escultura clássica, Raphael e Michelangelo como modelos, que haviam observado da "natureza", mas selecionou e idealizou o que eles retratavam e depreciava os maneiristas. Annibale Caracci, em particular, resgatou a arte de sua artificialidade, retornando à representação da natureza melhorada. O naturalismo de Caravaggio e seus seguidores também foram deplorados.
Faltava o período em que escrito sobre a teoria da arte, além da série de palestras para a Accademia di San Luca por Federico Zuccari, seu primeiro presidente. Estes foram publicados como L'Heage de 'Pittori, Scultori, Ed Architetti (1607), e foram chamados de "The Swan Song do misticismo subjetivo da teoria maneirista". As próprias palestras foram abandonadas quando as primeiras foram recebidas com hostilidade pelos bolonhesa e caravaggista. A idéia pode ter provocado Agucchi a iniciar seu próprio trabalho. Apesar de sua publicação atrasada e obscura, as idéias de Agucchi representam a exposição mais antiga da "teoria clássica-idealista" que deveria ser dominante na maior parte do mundo da arte romana no século XVII.
O jovem antiquário Francesco Angeloni, era um amigo íntimo que também havia trabalhado para o Aldobrandini, no seu caso, o Papa Clemente VIII e possuía pelo menos uma cópia do retrato de York. Angeloni criou seu sobrinho Gian Pietro Bellori (1613-1696), apresentando -o a Agucchi e aos artistas bolonhesa em Roma. Bellori deveria seguir muitas das idéias de Agucchi em seus próprios escritos muito influentes sobre a arte.
Silvia Ginzburg apontou que uma peça anterior de Agucchi, descrevendo della venere Dormiente di Annibale Carrezzi ("Descrição da Vênus adormecida de Annibale Carracci"), escrita em torno de 1603, mas não publicada até 1678, mostra atitudes bastante diferentes para pintar O estilo de Carracci e sua capacidade de pintar sem o primeiro desenho - nenhuma das qualidades da qual o Trattato aprova. Ela sugere que a reação ao estilo de Caravaggio é responsável pela mudança, que também pode ser referida em uma carta por Agucchi de 1603.
Agucchi também estava interessado em astronomia e matemática e membro da Accademia dei gelati de Bolonha. Ele teve uma longa correspondência com Galileu Galilei em 1611-13, incluindo a transmissão dos dados de suas próprias observações astronômicas, e lecionou sobre os satélites de Júpiter em 1611; Galileu fez as primeiras observações registradas em 1609.